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README: rewrite it, it was rather out-of-date master
authorMichael Orlitzky <michael@orlitzky.com>
Sat, 18 May 2024 21:11:21 +0000 (17:11 -0400)
committerMichael Orlitzky <michael@orlitzky.com>
Sat, 18 May 2024 21:11:21 +0000 (17:11 -0400)
COPYING [new file with mode: 0644]
LICENSE [new file with mode: 0644]
README
makefile
mjo/cone/all.py
mjo/cone/nonnegative_orthant.py [deleted file]
mjo/cone/rearrangement.py [deleted file]
mjo/cone/schur.py [deleted file]
mjo/cone/trivial_cone.py [deleted file]
mjo/eja/eja_element.py

diff --git a/COPYING b/COPYING
new file mode 100644 (file)
index 0000000..10b6a06
--- /dev/null
+++ b/COPYING
@@ -0,0 +1,15 @@
+sage.d: my personal library of SageMath code
+Copyright (C) 2024  Michael Orlitzky
+
+This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+it under the terms of the GNU Affero General Public License as
+published by the Free Software Foundation, either version 3 of the
+License, or (at your option) any later version.
+
+This program is distributed in the hope that it will be useful,
+but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
+GNU Affero General Public License for more details.
+
+You should have received a copy of the GNU Affero General Public License
+along with this program.  If not, see <https://www.gnu.org/licenses/>.
diff --git a/LICENSE b/LICENSE
new file mode 100644 (file)
index 0000000..be3f7b2
--- /dev/null
+++ b/LICENSE
@@ -0,0 +1,661 @@
+                    GNU AFFERO GENERAL PUBLIC LICENSE
+                       Version 3, 19 November 2007
+
+ Copyright (C) 2007 Free Software Foundation, Inc. <https://fsf.org/>
+ Everyone is permitted to copy and distribute verbatim copies
+ of this license document, but changing it is not allowed.
+
+                            Preamble
+
+  The GNU Affero General Public License is a free, copyleft license for
+software and other kinds of works, specifically designed to ensure
+cooperation with the community in the case of network server software.
+
+  The licenses for most software and other practical works are designed
+to take away your freedom to share and change the works.  By contrast,
+our General Public Licenses are intended to guarantee your freedom to
+share and change all versions of a program--to make sure it remains free
+software for all its users.
+
+  When we speak of free software, we are referring to freedom, not
+price.  Our General Public Licenses are designed to make sure that you
+have the freedom to distribute copies of free software (and charge for
+them if you wish), that you receive source code or can get it if you
+want it, that you can change the software or use pieces of it in new
+free programs, and that you know you can do these things.
+
+  Developers that use our General Public Licenses protect your rights
+with two steps: (1) assert copyright on the software, and (2) offer
+you this License which gives you legal permission to copy, distribute
+and/or modify the software.
+
+  A secondary benefit of defending all users' freedom is that
+improvements made in alternate versions of the program, if they
+receive widespread use, become available for other developers to
+incorporate.  Many developers of free software are heartened and
+encouraged by the resulting cooperation.  However, in the case of
+software used on network servers, this result may fail to come about.
+The GNU General Public License permits making a modified version and
+letting the public access it on a server without ever releasing its
+source code to the public.
+
+  The GNU Affero General Public License is designed specifically to
+ensure that, in such cases, the modified source code becomes available
+to the community.  It requires the operator of a network server to
+provide the source code of the modified version running there to the
+users of that server.  Therefore, public use of a modified version, on
+a publicly accessible server, gives the public access to the source
+code of the modified version.
+
+  An older license, called the Affero General Public License and
+published by Affero, was designed to accomplish similar goals.  This is
+a different license, not a version of the Affero GPL, but Affero has
+released a new version of the Affero GPL which permits relicensing under
+this license.
+
+  The precise terms and conditions for copying, distribution and
+modification follow.
+
+                       TERMS AND CONDITIONS
+
+  0. Definitions.
+
+  "This License" refers to version 3 of the GNU Affero General Public License.
+
+  "Copyright" also means copyright-like laws that apply to other kinds of
+works, such as semiconductor masks.
+
+  "The Program" refers to any copyrightable work licensed under this
+License.  Each licensee is addressed as "you".  "Licensees" and
+"recipients" may be individuals or organizations.
+
+  To "modify" a work means to copy from or adapt all or part of the work
+in a fashion requiring copyright permission, other than the making of an
+exact copy.  The resulting work is called a "modified version" of the
+earlier work or a work "based on" the earlier work.
+
+  A "covered work" means either the unmodified Program or a work based
+on the Program.
+
+  To "propagate" a work means to do anything with it that, without
+permission, would make you directly or secondarily liable for
+infringement under applicable copyright law, except executing it on a
+computer or modifying a private copy.  Propagation includes copying,
+distribution (with or without modification), making available to the
+public, and in some countries other activities as well.
+
+  To "convey" a work means any kind of propagation that enables other
+parties to make or receive copies.  Mere interaction with a user through
+a computer network, with no transfer of a copy, is not conveying.
+
+  An interactive user interface displays "Appropriate Legal Notices"
+to the extent that it includes a convenient and prominently visible
+feature that (1) displays an appropriate copyright notice, and (2)
+tells the user that there is no warranty for the work (except to the
+extent that warranties are provided), that licensees may convey the
+work under this License, and how to view a copy of this License.  If
+the interface presents a list of user commands or options, such as a
+menu, a prominent item in the list meets this criterion.
+
+  1. Source Code.
+
+  The "source code" for a work means the preferred form of the work
+for making modifications to it.  "Object code" means any non-source
+form of a work.
+
+  A "Standard Interface" means an interface that either is an official
+standard defined by a recognized standards body, or, in the case of
+interfaces specified for a particular programming language, one that
+is widely used among developers working in that language.
+
+  The "System Libraries" of an executable work include anything, other
+than the work as a whole, that (a) is included in the normal form of
+packaging a Major Component, but which is not part of that Major
+Component, and (b) serves only to enable use of the work with that
+Major Component, or to implement a Standard Interface for which an
+implementation is available to the public in source code form.  A
+"Major Component", in this context, means a major essential component
+(kernel, window system, and so on) of the specific operating system
+(if any) on which the executable work runs, or a compiler used to
+produce the work, or an object code interpreter used to run it.
+
+  The "Corresponding Source" for a work in object code form means all
+the source code needed to generate, install, and (for an executable
+work) run the object code and to modify the work, including scripts to
+control those activities.  However, it does not include the work's
+System Libraries, or general-purpose tools or generally available free
+programs which are used unmodified in performing those activities but
+which are not part of the work.  For example, Corresponding Source
+includes interface definition files associated with source files for
+the work, and the source code for shared libraries and dynamically
+linked subprograms that the work is specifically designed to require,
+such as by intimate data communication or control flow between those
+subprograms and other parts of the work.
+
+  The Corresponding Source need not include anything that users
+can regenerate automatically from other parts of the Corresponding
+Source.
+
+  The Corresponding Source for a work in source code form is that
+same work.
+
+  2. Basic Permissions.
+
+  All rights granted under this License are granted for the term of
+copyright on the Program, and are irrevocable provided the stated
+conditions are met.  This License explicitly affirms your unlimited
+permission to run the unmodified Program.  The output from running a
+covered work is covered by this License only if the output, given its
+content, constitutes a covered work.  This License acknowledges your
+rights of fair use or other equivalent, as provided by copyright law.
+
+  You may make, run and propagate covered works that you do not
+convey, without conditions so long as your license otherwise remains
+in force.  You may convey covered works to others for the sole purpose
+of having them make modifications exclusively for you, or provide you
+with facilities for running those works, provided that you comply with
+the terms of this License in conveying all material for which you do
+not control copyright.  Those thus making or running the covered works
+for you must do so exclusively on your behalf, under your direction
+and control, on terms that prohibit them from making any copies of
+your copyrighted material outside their relationship with you.
+
+  Conveying under any other circumstances is permitted solely under
+the conditions stated below.  Sublicensing is not allowed; section 10
+makes it unnecessary.
+
+  3. Protecting Users' Legal Rights From Anti-Circumvention Law.
+
+  No covered work shall be deemed part of an effective technological
+measure under any applicable law fulfilling obligations under article
+11 of the WIPO copyright treaty adopted on 20 December 1996, or
+similar laws prohibiting or restricting circumvention of such
+measures.
+
+  When you convey a covered work, you waive any legal power to forbid
+circumvention of technological measures to the extent such circumvention
+is effected by exercising rights under this License with respect to
+the covered work, and you disclaim any intention to limit operation or
+modification of the work as a means of enforcing, against the work's
+users, your or third parties' legal rights to forbid circumvention of
+technological measures.
+
+  4. Conveying Verbatim Copies.
+
+  You may convey verbatim copies of the Program's source code as you
+receive it, in any medium, provided that you conspicuously and
+appropriately publish on each copy an appropriate copyright notice;
+keep intact all notices stating that this License and any
+non-permissive terms added in accord with section 7 apply to the code;
+keep intact all notices of the absence of any warranty; and give all
+recipients a copy of this License along with the Program.
+
+  You may charge any price or no price for each copy that you convey,
+and you may offer support or warranty protection for a fee.
+
+  5. Conveying Modified Source Versions.
+
+  You may convey a work based on the Program, or the modifications to
+produce it from the Program, in the form of source code under the
+terms of section 4, provided that you also meet all of these conditions:
+
+    a) The work must carry prominent notices stating that you modified
+    it, and giving a relevant date.
+
+    b) The work must carry prominent notices stating that it is
+    released under this License and any conditions added under section
+    7.  This requirement modifies the requirement in section 4 to
+    "keep intact all notices".
+
+    c) You must license the entire work, as a whole, under this
+    License to anyone who comes into possession of a copy.  This
+    License will therefore apply, along with any applicable section 7
+    additional terms, to the whole of the work, and all its parts,
+    regardless of how they are packaged.  This License gives no
+    permission to license the work in any other way, but it does not
+    invalidate such permission if you have separately received it.
+
+    d) If the work has interactive user interfaces, each must display
+    Appropriate Legal Notices; however, if the Program has interactive
+    interfaces that do not display Appropriate Legal Notices, your
+    work need not make them do so.
+
+  A compilation of a covered work with other separate and independent
+works, which are not by their nature extensions of the covered work,
+and which are not combined with it such as to form a larger program,
+in or on a volume of a storage or distribution medium, is called an
+"aggregate" if the compilation and its resulting copyright are not
+used to limit the access or legal rights of the compilation's users
+beyond what the individual works permit.  Inclusion of a covered work
+in an aggregate does not cause this License to apply to the other
+parts of the aggregate.
+
+  6. Conveying Non-Source Forms.
+
+  You may convey a covered work in object code form under the terms
+of sections 4 and 5, provided that you also convey the
+machine-readable Corresponding Source under the terms of this License,
+in one of these ways:
+
+    a) Convey the object code in, or embodied in, a physical product
+    (including a physical distribution medium), accompanied by the
+    Corresponding Source fixed on a durable physical medium
+    customarily used for software interchange.
+
+    b) Convey the object code in, or embodied in, a physical product
+    (including a physical distribution medium), accompanied by a
+    written offer, valid for at least three years and valid for as
+    long as you offer spare parts or customer support for that product
+    model, to give anyone who possesses the object code either (1) a
+    copy of the Corresponding Source for all the software in the
+    product that is covered by this License, on a durable physical
+    medium customarily used for software interchange, for a price no
+    more than your reasonable cost of physically performing this
+    conveying of source, or (2) access to copy the
+    Corresponding Source from a network server at no charge.
+
+    c) Convey individual copies of the object code with a copy of the
+    written offer to provide the Corresponding Source.  This
+    alternative is allowed only occasionally and noncommercially, and
+    only if you received the object code with such an offer, in accord
+    with subsection 6b.
+
+    d) Convey the object code by offering access from a designated
+    place (gratis or for a charge), and offer equivalent access to the
+    Corresponding Source in the same way through the same place at no
+    further charge.  You need not require recipients to copy the
+    Corresponding Source along with the object code.  If the place to
+    copy the object code is a network server, the Corresponding Source
+    may be on a different server (operated by you or a third party)
+    that supports equivalent copying facilities, provided you maintain
+    clear directions next to the object code saying where to find the
+    Corresponding Source.  Regardless of what server hosts the
+    Corresponding Source, you remain obligated to ensure that it is
+    available for as long as needed to satisfy these requirements.
+
+    e) Convey the object code using peer-to-peer transmission, provided
+    you inform other peers where the object code and Corresponding
+    Source of the work are being offered to the general public at no
+    charge under subsection 6d.
+
+  A separable portion of the object code, whose source code is excluded
+from the Corresponding Source as a System Library, need not be
+included in conveying the object code work.
+
+  A "User Product" is either (1) a "consumer product", which means any
+tangible personal property which is normally used for personal, family,
+or household purposes, or (2) anything designed or sold for incorporation
+into a dwelling.  In determining whether a product is a consumer product,
+doubtful cases shall be resolved in favor of coverage.  For a particular
+product received by a particular user, "normally used" refers to a
+typical or common use of that class of product, regardless of the status
+of the particular user or of the way in which the particular user
+actually uses, or expects or is expected to use, the product.  A product
+is a consumer product regardless of whether the product has substantial
+commercial, industrial or non-consumer uses, unless such uses represent
+the only significant mode of use of the product.
+
+  "Installation Information" for a User Product means any methods,
+procedures, authorization keys, or other information required to install
+and execute modified versions of a covered work in that User Product from
+a modified version of its Corresponding Source.  The information must
+suffice to ensure that the continued functioning of the modified object
+code is in no case prevented or interfered with solely because
+modification has been made.
+
+  If you convey an object code work under this section in, or with, or
+specifically for use in, a User Product, and the conveying occurs as
+part of a transaction in which the right of possession and use of the
+User Product is transferred to the recipient in perpetuity or for a
+fixed term (regardless of how the transaction is characterized), the
+Corresponding Source conveyed under this section must be accompanied
+by the Installation Information.  But this requirement does not apply
+if neither you nor any third party retains the ability to install
+modified object code on the User Product (for example, the work has
+been installed in ROM).
+
+  The requirement to provide Installation Information does not include a
+requirement to continue to provide support service, warranty, or updates
+for a work that has been modified or installed by the recipient, or for
+the User Product in which it has been modified or installed.  Access to a
+network may be denied when the modification itself materially and
+adversely affects the operation of the network or violates the rules and
+protocols for communication across the network.
+
+  Corresponding Source conveyed, and Installation Information provided,
+in accord with this section must be in a format that is publicly
+documented (and with an implementation available to the public in
+source code form), and must require no special password or key for
+unpacking, reading or copying.
+
+  7. Additional Terms.
+
+  "Additional permissions" are terms that supplement the terms of this
+License by making exceptions from one or more of its conditions.
+Additional permissions that are applicable to the entire Program shall
+be treated as though they were included in this License, to the extent
+that they are valid under applicable law.  If additional permissions
+apply only to part of the Program, that part may be used separately
+under those permissions, but the entire Program remains governed by
+this License without regard to the additional permissions.
+
+  When you convey a copy of a covered work, you may at your option
+remove any additional permissions from that copy, or from any part of
+it.  (Additional permissions may be written to require their own
+removal in certain cases when you modify the work.)  You may place
+additional permissions on material, added by you to a covered work,
+for which you have or can give appropriate copyright permission.
+
+  Notwithstanding any other provision of this License, for material you
+add to a covered work, you may (if authorized by the copyright holders of
+that material) supplement the terms of this License with terms:
+
+    a) Disclaiming warranty or limiting liability differently from the
+    terms of sections 15 and 16 of this License; or
+
+    b) Requiring preservation of specified reasonable legal notices or
+    author attributions in that material or in the Appropriate Legal
+    Notices displayed by works containing it; or
+
+    c) Prohibiting misrepresentation of the origin of that material, or
+    requiring that modified versions of such material be marked in
+    reasonable ways as different from the original version; or
+
+    d) Limiting the use for publicity purposes of names of licensors or
+    authors of the material; or
+
+    e) Declining to grant rights under trademark law for use of some
+    trade names, trademarks, or service marks; or
+
+    f) Requiring indemnification of licensors and authors of that
+    material by anyone who conveys the material (or modified versions of
+    it) with contractual assumptions of liability to the recipient, for
+    any liability that these contractual assumptions directly impose on
+    those licensors and authors.
+
+  All other non-permissive additional terms are considered "further
+restrictions" within the meaning of section 10.  If the Program as you
+received it, or any part of it, contains a notice stating that it is
+governed by this License along with a term that is a further
+restriction, you may remove that term.  If a license document contains
+a further restriction but permits relicensing or conveying under this
+License, you may add to a covered work material governed by the terms
+of that license document, provided that the further restriction does
+not survive such relicensing or conveying.
+
+  If you add terms to a covered work in accord with this section, you
+must place, in the relevant source files, a statement of the
+additional terms that apply to those files, or a notice indicating
+where to find the applicable terms.
+
+  Additional terms, permissive or non-permissive, may be stated in the
+form of a separately written license, or stated as exceptions;
+the above requirements apply either way.
+
+  8. Termination.
+
+  You may not propagate or modify a covered work except as expressly
+provided under this License.  Any attempt otherwise to propagate or
+modify it is void, and will automatically terminate your rights under
+this License (including any patent licenses granted under the third
+paragraph of section 11).
+
+  However, if you cease all violation of this License, then your
+license from a particular copyright holder is reinstated (a)
+provisionally, unless and until the copyright holder explicitly and
+finally terminates your license, and (b) permanently, if the copyright
+holder fails to notify you of the violation by some reasonable means
+prior to 60 days after the cessation.
+
+  Moreover, your license from a particular copyright holder is
+reinstated permanently if the copyright holder notifies you of the
+violation by some reasonable means, this is the first time you have
+received notice of violation of this License (for any work) from that
+copyright holder, and you cure the violation prior to 30 days after
+your receipt of the notice.
+
+  Termination of your rights under this section does not terminate the
+licenses of parties who have received copies or rights from you under
+this License.  If your rights have been terminated and not permanently
+reinstated, you do not qualify to receive new licenses for the same
+material under section 10.
+
+  9. Acceptance Not Required for Having Copies.
+
+  You are not required to accept this License in order to receive or
+run a copy of the Program.  Ancillary propagation of a covered work
+occurring solely as a consequence of using peer-to-peer transmission
+to receive a copy likewise does not require acceptance.  However,
+nothing other than this License grants you permission to propagate or
+modify any covered work.  These actions infringe copyright if you do
+not accept this License.  Therefore, by modifying or propagating a
+covered work, you indicate your acceptance of this License to do so.
+
+  10. Automatic Licensing of Downstream Recipients.
+
+  Each time you convey a covered work, the recipient automatically
+receives a license from the original licensors, to run, modify and
+propagate that work, subject to this License.  You are not responsible
+for enforcing compliance by third parties with this License.
+
+  An "entity transaction" is a transaction transferring control of an
+organization, or substantially all assets of one, or subdividing an
+organization, or merging organizations.  If propagation of a covered
+work results from an entity transaction, each party to that
+transaction who receives a copy of the work also receives whatever
+licenses to the work the party's predecessor in interest had or could
+give under the previous paragraph, plus a right to possession of the
+Corresponding Source of the work from the predecessor in interest, if
+the predecessor has it or can get it with reasonable efforts.
+
+  You may not impose any further restrictions on the exercise of the
+rights granted or affirmed under this License.  For example, you may
+not impose a license fee, royalty, or other charge for exercise of
+rights granted under this License, and you may not initiate litigation
+(including a cross-claim or counterclaim in a lawsuit) alleging that
+any patent claim is infringed by making, using, selling, offering for
+sale, or importing the Program or any portion of it.
+
+  11. Patents.
+
+  A "contributor" is a copyright holder who authorizes use under this
+License of the Program or a work on which the Program is based.  The
+work thus licensed is called the contributor's "contributor version".
+
+  A contributor's "essential patent claims" are all patent claims
+owned or controlled by the contributor, whether already acquired or
+hereafter acquired, that would be infringed by some manner, permitted
+by this License, of making, using, or selling its contributor version,
+but do not include claims that would be infringed only as a
+consequence of further modification of the contributor version.  For
+purposes of this definition, "control" includes the right to grant
+patent sublicenses in a manner consistent with the requirements of
+this License.
+
+  Each contributor grants you a non-exclusive, worldwide, royalty-free
+patent license under the contributor's essential patent claims, to
+make, use, sell, offer for sale, import and otherwise run, modify and
+propagate the contents of its contributor version.
+
+  In the following three paragraphs, a "patent license" is any express
+agreement or commitment, however denominated, not to enforce a patent
+(such as an express permission to practice a patent or covenant not to
+sue for patent infringement).  To "grant" such a patent license to a
+party means to make such an agreement or commitment not to enforce a
+patent against the party.
+
+  If you convey a covered work, knowingly relying on a patent license,
+and the Corresponding Source of the work is not available for anyone
+to copy, free of charge and under the terms of this License, through a
+publicly available network server or other readily accessible means,
+then you must either (1) cause the Corresponding Source to be so
+available, or (2) arrange to deprive yourself of the benefit of the
+patent license for this particular work, or (3) arrange, in a manner
+consistent with the requirements of this License, to extend the patent
+license to downstream recipients.  "Knowingly relying" means you have
+actual knowledge that, but for the patent license, your conveying the
+covered work in a country, or your recipient's use of the covered work
+in a country, would infringe one or more identifiable patents in that
+country that you have reason to believe are valid.
+
+  If, pursuant to or in connection with a single transaction or
+arrangement, you convey, or propagate by procuring conveyance of, a
+covered work, and grant a patent license to some of the parties
+receiving the covered work authorizing them to use, propagate, modify
+or convey a specific copy of the covered work, then the patent license
+you grant is automatically extended to all recipients of the covered
+work and works based on it.
+
+  A patent license is "discriminatory" if it does not include within
+the scope of its coverage, prohibits the exercise of, or is
+conditioned on the non-exercise of one or more of the rights that are
+specifically granted under this License.  You may not convey a covered
+work if you are a party to an arrangement with a third party that is
+in the business of distributing software, under which you make payment
+to the third party based on the extent of your activity of conveying
+the work, and under which the third party grants, to any of the
+parties who would receive the covered work from you, a discriminatory
+patent license (a) in connection with copies of the covered work
+conveyed by you (or copies made from those copies), or (b) primarily
+for and in connection with specific products or compilations that
+contain the covered work, unless you entered into that arrangement,
+or that patent license was granted, prior to 28 March 2007.
+
+  Nothing in this License shall be construed as excluding or limiting
+any implied license or other defenses to infringement that may
+otherwise be available to you under applicable patent law.
+
+  12. No Surrender of Others' Freedom.
+
+  If conditions are imposed on you (whether by court order, agreement or
+otherwise) that contradict the conditions of this License, they do not
+excuse you from the conditions of this License.  If you cannot convey a
+covered work so as to satisfy simultaneously your obligations under this
+License and any other pertinent obligations, then as a consequence you may
+not convey it at all.  For example, if you agree to terms that obligate you
+to collect a royalty for further conveying from those to whom you convey
+the Program, the only way you could satisfy both those terms and this
+License would be to refrain entirely from conveying the Program.
+
+  13. Remote Network Interaction; Use with the GNU General Public License.
+
+  Notwithstanding any other provision of this License, if you modify the
+Program, your modified version must prominently offer all users
+interacting with it remotely through a computer network (if your version
+supports such interaction) an opportunity to receive the Corresponding
+Source of your version by providing access to the Corresponding Source
+from a network server at no charge, through some standard or customary
+means of facilitating copying of software.  This Corresponding Source
+shall include the Corresponding Source for any work covered by version 3
+of the GNU General Public License that is incorporated pursuant to the
+following paragraph.
+
+  Notwithstanding any other provision of this License, you have
+permission to link or combine any covered work with a work licensed
+under version 3 of the GNU General Public License into a single
+combined work, and to convey the resulting work.  The terms of this
+License will continue to apply to the part which is the covered work,
+but the work with which it is combined will remain governed by version
+3 of the GNU General Public License.
+
+  14. Revised Versions of this License.
+
+  The Free Software Foundation may publish revised and/or new versions of
+the GNU Affero General Public License from time to time.  Such new versions
+will be similar in spirit to the present version, but may differ in detail to
+address new problems or concerns.
+
+  Each version is given a distinguishing version number.  If the
+Program specifies that a certain numbered version of the GNU Affero General
+Public License "or any later version" applies to it, you have the
+option of following the terms and conditions either of that numbered
+version or of any later version published by the Free Software
+Foundation.  If the Program does not specify a version number of the
+GNU Affero General Public License, you may choose any version ever published
+by the Free Software Foundation.
+
+  If the Program specifies that a proxy can decide which future
+versions of the GNU Affero General Public License can be used, that proxy's
+public statement of acceptance of a version permanently authorizes you
+to choose that version for the Program.
+
+  Later license versions may give you additional or different
+permissions.  However, no additional obligations are imposed on any
+author or copyright holder as a result of your choosing to follow a
+later version.
+
+  15. Disclaimer of Warranty.
+
+  THERE IS NO WARRANTY FOR THE PROGRAM, TO THE EXTENT PERMITTED BY
+APPLICABLE LAW.  EXCEPT WHEN OTHERWISE STATED IN WRITING THE COPYRIGHT
+HOLDERS AND/OR OTHER PARTIES PROVIDE THE PROGRAM "AS IS" WITHOUT WARRANTY
+OF ANY KIND, EITHER EXPRESSED OR IMPLIED, INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO,
+THE IMPLIED WARRANTIES OF MERCHANTABILITY AND FITNESS FOR A PARTICULAR
+PURPOSE.  THE ENTIRE RISK AS TO THE QUALITY AND PERFORMANCE OF THE PROGRAM
+IS WITH YOU.  SHOULD THE PROGRAM PROVE DEFECTIVE, YOU ASSUME THE COST OF
+ALL NECESSARY SERVICING, REPAIR OR CORRECTION.
+
+  16. Limitation of Liability.
+
+  IN NO EVENT UNLESS REQUIRED BY APPLICABLE LAW OR AGREED TO IN WRITING
+WILL ANY COPYRIGHT HOLDER, OR ANY OTHER PARTY WHO MODIFIES AND/OR CONVEYS
+THE PROGRAM AS PERMITTED ABOVE, BE LIABLE TO YOU FOR DAMAGES, INCLUDING ANY
+GENERAL, SPECIAL, INCIDENTAL OR CONSEQUENTIAL DAMAGES ARISING OUT OF THE
+USE OR INABILITY TO USE THE PROGRAM (INCLUDING BUT NOT LIMITED TO LOSS OF
+DATA OR DATA BEING RENDERED INACCURATE OR LOSSES SUSTAINED BY YOU OR THIRD
+PARTIES OR A FAILURE OF THE PROGRAM TO OPERATE WITH ANY OTHER PROGRAMS),
+EVEN IF SUCH HOLDER OR OTHER PARTY HAS BEEN ADVISED OF THE POSSIBILITY OF
+SUCH DAMAGES.
+
+  17. Interpretation of Sections 15 and 16.
+
+  If the disclaimer of warranty and limitation of liability provided
+above cannot be given local legal effect according to their terms,
+reviewing courts shall apply local law that most closely approximates
+an absolute waiver of all civil liability in connection with the
+Program, unless a warranty or assumption of liability accompanies a
+copy of the Program in return for a fee.
+
+                     END OF TERMS AND CONDITIONS
+
+            How to Apply These Terms to Your New Programs
+
+  If you develop a new program, and you want it to be of the greatest
+possible use to the public, the best way to achieve this is to make it
+free software which everyone can redistribute and change under these terms.
+
+  To do so, attach the following notices to the program.  It is safest
+to attach them to the start of each source file to most effectively
+state the exclusion of warranty; and each file should have at least
+the "copyright" line and a pointer to where the full notice is found.
+
+    <one line to give the program's name and a brief idea of what it does.>
+    Copyright (C) <year>  <name of author>
+
+    This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+    it under the terms of the GNU Affero General Public License as published by
+    the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
+    (at your option) any later version.
+
+    This program is distributed in the hope that it will be useful,
+    but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+    MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
+    GNU Affero General Public License for more details.
+
+    You should have received a copy of the GNU Affero General Public License
+    along with this program.  If not, see <https://www.gnu.org/licenses/>.
+
+Also add information on how to contact you by electronic and paper mail.
+
+  If your software can interact with users remotely through a computer
+network, you should also make sure that it provides a way for users to
+get its source.  For example, if your program is a web application, its
+interface could display a "Source" link that leads users to an archive
+of the code.  There are many ways you could offer source, and different
+solutions will be better for different programs; see section 13 for the
+specific requirements.
+
+  You should also get your employer (if you work as a programmer) or school,
+if any, to sign a "copyright disclaimer" for the program, if necessary.
+For more information on this, and how to apply and follow the GNU AGPL, see
+<https://www.gnu.org/licenses/>.
diff --git a/README b/README
index eb9fd9f95838fcbd21f71f0844ad2a6ee453444f..e7c660d0029df424944ba827c0785f23a9151100 100644 (file)
--- a/README
+++ b/README
@@ -1,12 +1,11 @@
-My own personal library of Sage[1] code.
+My personal library of SageMath code
 
-It is intended to be loaded into every Sage session, or Python script
-which imports the Sage library. Sage loads ~/.sage/init.sage upon
-startup, so I've supplied a sample init.sage file which will load this
-code from ~/src/sage/.
+If you symlink it to ~/.sage/init.sage, the sample init.sage file will
+load this stuff into your session when Sage starts. It assumes that
+this repository lives at either ~/src/sage.d or ~/src/sage.d.git, but
+that's easy to change. More likely though you will want to copy/paste
+the relevant parts into your own personal (preexisting) init.sage.
 
 Newer versions of Sage don't load ~/.sage/init.sage during test mode,
-and "packages" need to be imported explicitly. Therefore the test
-suite is a little tricky to run; but "make check" should work.
-
-[1] http://www.sagemath.org/
+and all modules need to be imported explicitly. The test suite is
+therefore a little tricky to run; but "make check" should work.
index 63b577a3880ddcc48daa0db5ef797bd9c0e8cef3..79cf89af52ad6b6db15204ea7fe7d0b6cad30dd0 100644 (file)
--- a/makefile
+++ b/makefile
@@ -1,7 +1,7 @@
 SAGE = $(shell which sage)
 
 check:
-       PYTHONPATH="." $(SAGE) -t --timeout=0 --long --exitfirst mjo/
+       PYTHONPATH="." $(SAGE) -t --long --exitfirst mjo/
 clean:
        find ./ -type f -name '*.pyc' -delete
        find ./ -type d -name '__pycache__' -delete
index 7ce56c0bf41f6f18123155c6b232bd52594b5905..2ef437f26b045543b2f8097ba4645ae605edfc62 100644 (file)
@@ -6,10 +6,6 @@ from mjo.cone.cone import *
 from mjo.cone.completely_positive import *
 from mjo.cone.doubly_nonnegative import *
 from mjo.cone.faces import *
-from mjo.cone.nonnegative_orthant import *
 from mjo.cone.permutation_invariant import *
-from mjo.cone.rearrangement import *
-from mjo.cone.schur import *
 from mjo.cone.symmetric_pd import *
 from mjo.cone.symmetric_psd import *
-from mjo.cone.trivial_cone import *
diff --git a/mjo/cone/nonnegative_orthant.py b/mjo/cone/nonnegative_orthant.py
deleted file mode 100644 (file)
index 2bd1b3c..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,80 +0,0 @@
-r"""
-The nonnegative orthant in `\mathbb{Z}^{n}`. I'm sick and tired of
-typing it.
-"""
-
-from sage.all import *
-
-def nonnegative_orthant(n, lattice=None):
-    r"""
-    The nonnegative orthant in ``n`` dimensions.
-
-    INPUT:
-
-      - ``n`` -- the dimension of the ambient space.
-
-      - ``lattice`` -- (default: ``None``) an ambient lattice of rank ``n``
-                       to be passed to the :func:`Cone` constructor.
-
-    OUTPUT:
-
-    The convex cone having ``n`` standard basis vectors as its
-    generators. Each generating ray will have the integer ring as its
-    base ring.
-
-    If a ``lattice`` was specified, then the resulting cone will live in
-    that lattice unless its rank is incompatible with the dimension
-    ``n`` (in which case a ``ValueError`` is raised).
-
-    SETUP::
-
-        sage: from mjo.cone.nonnegative_orthant import nonnegative_orthant
-
-    EXAMPLES::
-
-        sage: nonnegative_orthant(3).rays()
-        N(1, 0, 0),
-        N(0, 1, 0),
-        N(0, 0, 1)
-        in 3-d lattice N
-
-    TESTS:
-
-    We can construct the trivial cone as the nonnegative orthant in a
-    trivial vector space::
-
-        sage: nonnegative_orthant(0)
-        0-d cone in 0-d lattice N
-
-    The nonnegative orthant is a proper cone::
-
-        sage: n = ZZ.random_element(10)
-        sage: K = nonnegative_orthant(n)
-        sage: K.is_proper()
-        True
-
-    If a ``lattice`` was given, it is actually used::
-
-        sage: L = ToricLattice(3, 'M')
-        sage: nonnegative_orthant(3, lattice=L)
-        3-d cone in 3-d lattice M
-
-    Unless the rank of the lattice disagrees with ``n``::
-
-        sage: L = ToricLattice(1, 'M')
-        sage: nonnegative_orthant(3, lattice=L)
-        Traceback (most recent call last):
-        ...
-        ValueError: lattice rank=1 and dimension n=3 are incompatible
-
-    """
-    if lattice is None:
-        lattice = ToricLattice(n)
-
-    if lattice.rank() != n:
-        raise ValueError('lattice rank=%d and dimension n=%d are incompatible'
-                         %
-                         (lattice.rank(), n))
-
-    I = identity_matrix(ZZ,n)
-    return Cone(I.rows(), lattice)
diff --git a/mjo/cone/rearrangement.py b/mjo/cone/rearrangement.py
deleted file mode 100644 (file)
index 0bbf95b..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,194 +0,0 @@
-from sage.all import *
-
-def rearrangement_cone(p,n,lattice=None):
-    r"""
-    Return the rearrangement cone of order ``p`` in ``n`` dimensions.
-
-    The rearrangement cone in ``n`` dimensions has as its elements
-    vectors of length ``n``. For inclusion in the cone, the smallest
-    ``p`` components of a vector must sum to a nonnegative number.
-
-    For example, the rearrangement cone of order ``p == 1`` has its
-    single smallest component nonnegative. This implies that all
-    components are nonnegative, and that therefore the rearrangement
-    cone of order one is the nonnegative orthant.
-
-    When ``p == n``, the sum of all components of a vector must be
-    nonnegative for inclusion in the cone. That is, the cone is a
-    half-space in ``n`` dimensions.
-
-    INPUT:
-
-      - ``p`` -- The number of components to "rearrange."
-
-      - ``n`` -- The dimension of the ambient space for the resulting cone.
-
-      - ``lattice`` -- (default: ``None``) an ambient lattice of rank ``n``
-                       to be passed to the :func:`Cone` constructor.
-
-    OUTPUT:
-
-    A polyhedral closed convex cone object representing a rearrangement
-    cone of order ``p`` in ``n`` dimensions. Each generating ray will
-    have the integer ring as its base ring.
-
-    If a ``lattice`` was specified, then the resulting cone will live in
-    that lattice unless its rank is incompatible with the dimension
-    ``n`` (in which case a ``ValueError`` is raised).
-
-    ALGORITHM:
-
-    The generators for the rearrangement cone are given by [Jeong]_
-    Theorem 5.2.3.
-
-    REFERENCES:
-
-    .. [GowdaJeong] Muddappa Seetharama Gowda and Juyoung Jeong.
-       Spectral cones in Euclidean Jordan algebras.
-       Linear Algebra and its Applications, 509, 286-305.
-       doi:10.1016/j.laa.2016.08.004
-
-    .. [HenrionSeeger] Rene Henrion and Alberto Seeger.
-       Inradius and Circumradius of Various Convex Cones Arising in
-       Applications. Set-Valued and Variational Analysis, 18(3-4),
-       483-511, 2010. doi:10.1007/s11228-010-0150-z
-
-    .. [Jeong] Juyoung Jeong.
-       Spectral sets and functions on Euclidean Jordan algebras.
-       University of Maryland, Baltimore County, Ph.D. thesis, 2017.
-
-    SETUP::
-
-        sage: from mjo.cone.rearrangement import rearrangement_cone
-
-    EXAMPLES:
-
-    The rearrangement cones of order one are nonnegative orthants::
-
-        sage: rearrangement_cone(1,1) == Cone([(1,)])
-        True
-        sage: rearrangement_cone(1,2) == Cone([(0,1),(1,0)])
-        True
-        sage: rearrangement_cone(1,3) == Cone([(0,0,1),(0,1,0),(1,0,0)])
-        True
-
-    When ``p == n``, the resulting cone will be a half-space, so we
-    expect its lineality to be one less than ``n`` because it will
-    contain a hyperplane but is not the entire space::
-
-        sage: rearrangement_cone(5,5).lineality()
-        4
-
-    All rearrangement cones are proper when ``p`` is less than ``n`` by
-    [Jeong]_ Proposition 5.2.1::
-
-        sage: all( rearrangement_cone(p,n).is_proper()
-        ....:              for n in range(10)
-        ....:              for p in range(1, n) )
-        True
-
-    The Lyapunov rank of the rearrangement cone of order ``p`` in ``n``
-    dimensions is ``n`` for ``p == 1`` or ``p == n`` and one otherwise,
-    by [Jeong]_ Corollary 5.2.4::
-
-        sage: all( rearrangement_cone(p,n).lyapunov_rank() == n
-        ....:              for n in range(2, 10)
-        ....:              for p in [1, n-1] )
-        True
-        sage: all( rearrangement_cone(p,n).lyapunov_rank() == 1
-        ....:              for n in range(3, 10)
-        ....:              for p in range(2, n-1) )
-        True
-
-    TESTS:
-
-    All rearrangement cones are permutation-invariant by [Jeong]_
-    Proposition 5.2.1::
-
-        sage: n = ZZ.random_element(2,10).abs()
-        sage: p = ZZ.random_element(1,n)
-        sage: K = rearrangement_cone(p,n)
-        sage: P = SymmetricGroup(n).random_element().matrix()
-        sage: all( K.contains(P*r) for r in K )
-        True
-
-    The smallest ``p`` components of every element of the rearrangement
-    cone should sum to a nonnegative number (this tests that the
-    generators really are what we think they are)::
-
-        sage: def _has_rearrangement_property(v,p):
-        ....:     return sum( sorted(v)[0:p] ) >= 0
-        sage: all( _has_rearrangement_property(
-        ....:      rearrangement_cone(p,n).random_element(),
-        ....:      p
-        ....:    )
-        ....:    for n in range(2, 10)
-        ....:    for p in range(1, n-1)
-        ....: )
-        True
-
-    The rearrangenent cone of order ``p`` is contained in the rearrangement
-    cone of order ``p + 1`` by [Jeong]_ Proposition 5.2.1::
-
-        sage: n = ZZ.random_element(2,10)
-        sage: p = ZZ.random_element(1,n)
-        sage: K1 = rearrangement_cone(p,n)
-        sage: K2 = rearrangement_cone(p+1,n)
-        sage: all( x in K2 for x in K1 )
-        True
-
-    The rearrangement cone of order ``p`` is linearly isomorphic to the
-    rearrangement cone of order ``n - p`` when ``p`` is less than ``n``,
-    by [Jeong]_ Proposition 5.2.1::
-
-        sage: n = ZZ.random_element(2,10)
-        sage: p = ZZ.random_element(1,n)
-        sage: K1 = rearrangement_cone(p,n)
-        sage: K2 = rearrangement_cone(n-p, n)
-        sage: Mp = (1/p)*matrix.ones(QQ,n) - identity_matrix(QQ,n)
-        sage: Cone( (Mp*K2.rays()).columns() ).is_equivalent(K1)
-        True
-
-    The order ``p`` should be between ``1`` and ``n``, inclusive::
-
-        sage: rearrangement_cone(0,3)
-        Traceback (most recent call last):
-        ...
-        ValueError: order p=0 should be between 1 and n=3, inclusive
-        sage: rearrangement_cone(5,3)
-        Traceback (most recent call last):
-        ...
-        ValueError: order p=5 should be between 1 and n=3, inclusive
-
-    If a ``lattice`` was given, it is actually used::
-
-        sage: L = ToricLattice(3, 'M')
-        sage: rearrangement_cone(2, 3, lattice=L)
-        3-d cone in 3-d lattice M
-
-    Unless the rank of the lattice disagrees with ``n``::
-
-        sage: L = ToricLattice(1, 'M')
-        sage: rearrangement_cone(2, 3, lattice=L)
-        Traceback (most recent call last):
-        ...
-        ValueError: lattice rank=1 and dimension n=3 are incompatible
-
-    """
-    if p < 1 or p > n:
-        raise ValueError('order p=%d should be between 1 and n=%d, inclusive'
-                         %
-                         (p,n))
-
-    if lattice is None:
-        lattice = ToricLattice(n)
-
-    if lattice.rank() != n:
-        raise ValueError('lattice rank=%d and dimension n=%d are incompatible'
-                         %
-                         (lattice.rank(), n))
-
-    I = identity_matrix(ZZ,n)
-    M = matrix.ones(ZZ,n) - p*I
-    G = identity_matrix(ZZ,n).rows() + M.rows()
-    return Cone(G, lattice=lattice)
diff --git a/mjo/cone/schur.py b/mjo/cone/schur.py
deleted file mode 100644 (file)
index 1fa1e52..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,131 +0,0 @@
-"""
-The Schur cone, as described in the "Critical angles..." papers by
-Iusem, Seeger, and Sossa. It defines the Schur ordering on `R^{n}`.
-"""
-
-from sage.all import *
-
-def schur_cone(n, lattice=None):
-    r"""
-    Return the Schur cone in ``n`` dimensions that induces the
-    majorization ordering.
-
-    INPUT:
-
-      - ``n`` -- the dimension the ambient space.
-
-      - ``lattice`` -- (default: ``None``) an ambient lattice of rank ``n``
-                       to be passed to the :func:`Cone` constructor.
-
-    OUTPUT:
-
-    A rational closed convex Schur cone of dimension ``n``. Each
-    generating ray will have the integer ring as its base ring.
-
-    If a ``lattice`` was specified, then the resulting cone will live in
-    that lattice unless its rank is incompatible with the dimension
-    ``n`` (in which case a ``ValueError`` is raised).
-
-    REFERENCES:
-
-    .. [GourionSeeger] Daniel Gourion and Alberto Seeger.
-       Critical angles in polyhedral convex cones: numerical and
-       statistical considerations. Mathematical Programming, 123:173-198,
-       2010, doi:10.1007/s10107-009-0317-2.
-
-    .. [IusemSeegerOnPairs] Alfredo Iusem and Alberto Seeger.
-       On pairs of vectors achieving the maximal angle of a convex cone.
-       Mathematical Programming, 104(2-3):501-523, 2005,
-       doi:10.1007/s10107-005-0626-z.
-
-    .. [SeegerSossaI] Alberto Seeger and David Sossa.
-       Critical angles between two convex cones I. General theory.
-       TOP, 24(1):44-65, 2016, doi:10.1007/s11750-015-0375-y.
-
-    SETUP::
-
-        sage: from mjo.cone.nonnegative_orthant import nonnegative_orthant
-        sage: from mjo.cone.schur import schur_cone
-
-    EXAMPLES:
-
-    Verify the claim that the maximal angle between any two generators
-    of the Schur cone and the nonnegative quintant is ``3*pi/4``::
-
-        sage: P = schur_cone(5)
-        sage: Q = nonnegative_orthant(5)
-        sage: G = ( g.change_ring(QQbar).normalized() for g in P )
-        sage: H = ( h.change_ring(QQbar).normalized() for h in Q )
-        sage: actual = max(arccos(u.inner_product(v)) for u in G for v in H)
-        sage: expected = 3*pi/4
-        sage: abs(actual - expected).n() < 1e-12
-        True
-
-    The dual of the Schur cone is the "downward monotonic cone"
-    [GourionSeeger]_, whose elements' entries are in non-increasing
-    order::
-
-        sage: n = ZZ.random_element(10)
-        sage: K = schur_cone(n).dual()
-        sage: x = K.random_element()
-        sage: all( x[i] >= x[i+1] for i in range(n-1) )
-        True
-
-    TESTS:
-
-    We get the trivial cone when ``n`` is zero::
-
-        sage: schur_cone(0).is_trivial()
-        True
-
-    The Schur cone induces the majorization ordering::
-
-        sage: def majorized_by(x,y):
-        ....:     return (all(sum(x[0:i]) <= sum(y[0:i])
-        ....:                 for i in range(x.degree()-1))
-        ....:             and sum(x) == sum(y))
-        sage: n = ZZ.random_element(10)
-        sage: V = VectorSpace(QQ, n)
-        sage: S = schur_cone(n)
-        sage: majorized_by(V.zero(), S.random_element())
-        True
-        sage: x = V.random_element()
-        sage: y = V.random_element()
-        sage: majorized_by(x,y) == ( (y-x) in S )
-        True
-
-    If a ``lattice`` was given, it is actually used::
-
-        sage: L = ToricLattice(3, 'M')
-        sage: schur_cone(3, lattice=L)
-        2-d cone in 3-d lattice M
-
-    Unless the rank of the lattice disagrees with ``n``::
-
-        sage: L = ToricLattice(1, 'M')
-        sage: schur_cone(3, lattice=L)
-        Traceback (most recent call last):
-        ...
-        ValueError: lattice rank=1 and dimension n=3 are incompatible
-
-    """
-    if lattice is None:
-        lattice = ToricLattice(n)
-
-    if lattice.rank() != n:
-        raise ValueError('lattice rank=%d and dimension n=%d are incompatible'
-                         %
-                         (lattice.rank(), n))
-
-    def _f(i,j):
-        if i == j:
-            return 1
-        elif j - i == 1:
-            return -1
-        else:
-            return 0
-
-    # The "max" below catches the trivial case where n == 0.
-    S = matrix(ZZ, max(0,n-1), n, _f)
-
-    return Cone(S.rows(), lattice)
diff --git a/mjo/cone/trivial_cone.py b/mjo/cone/trivial_cone.py
deleted file mode 100644 (file)
index 17c6835..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,64 +0,0 @@
-from sage.all import *
-
-def trivial_cone(n, lattice=None):
-    r"""
-    The trivial cone with no generators in ``n`` dimensions.
-
-    INPUT:
-
-      - ``n`` -- the dimension of the ambient space.
-
-      - ``lattice`` -- (default: ``None``) an ambient lattice of rank ``n``
-                       to be passed to the :func:`Cone` constructor.
-
-    OUTPUT:
-
-    The trivial cone with no generators.
-
-    If a ``lattice`` was specified, then the resulting cone will live in
-    that lattice unless its rank is incompatible with the dimension
-    ``n`` (in which case a ``ValueError`` is raised).
-
-    SETUP::
-
-        sage: from mjo.cone.trivial_cone import trivial_cone
-
-    EXAMPLES::
-
-    We can construct the trivial cone as the nonnegative orthant in a
-    trivial ambient space::
-
-        sage: trivial_cone(0)
-        0-d cone in 0-d lattice N
-
-    Or in a nontrivial ambient space::
-
-        sage: trivial_cone(3)
-        0-d cone in 3-d lattice N
-
-    If a ``lattice`` is given, the trivial cone will live in that lattice::
-
-        sage: L = ToricLattice(3, 'M')
-        sage: trivial_cone(3, lattice=L)
-        0-d cone in 3-d lattice M
-
-    TESTS:
-
-    An error is raised if the rank of the lattice disagrees with ``n``::
-
-        sage: L = ToricLattice(1, 'M')
-        sage: trivial_cone(3, lattice=L)
-        Traceback (most recent call last):
-        ...
-        ValueError: lattice rank=1 and dimension n=3 are incompatible
-
-    """
-    if lattice is None:
-        lattice = ToricLattice(n)
-
-    if lattice.rank() != n:
-        raise ValueError('lattice rank=%d and dimension n=%d are incompatible'
-                         %
-                         (lattice.rank(), n))
-
-    return Cone([], lattice)
index a229fa3f5290854bb3414280b6724f66d3918708..f4d5995ce9302d2fdc518dac2b0ca20f0fadf6d1 100644 (file)
@@ -555,7 +555,7 @@ class EJAElement(IndexedFreeModuleElement):
 
         If computing my determinant will be fast, we do so and compare
         with zero (Proposition II.2.4 in Faraut and
-        Koranyi). Otherwise, Proposition II.3.2 in Faraut and Koranyi
+        Korányi). Otherwise, Proposition II.3.2 in Faraut and Korányi
         reduces the problem to the invertibility of my quadratic
         representation.
 
@@ -1575,7 +1575,75 @@ class EJAElement(IndexedFreeModuleElement):
         # we want the negative of THAT for the trace.
         return -p(*self.to_vector())
 
-    def operator_inner_product(self, other):
+
+    def trace_inner_product(self, other):
+        """
+        Return the trace inner product of myself and ``other``.
+
+        SETUP::
+
+            sage: from mjo.eja.eja_algebra import random_eja
+
+        TESTS:
+
+        The trace inner product is commutative, bilinear, and associative::
+
+            sage: J = random_eja()
+            sage: x,y,z = J.random_elements(3)
+            sage: # commutative
+            sage: x.trace_inner_product(y) == y.trace_inner_product(x)
+            True
+            sage: # bilinear
+            sage: a = J.base_ring().random_element()
+            sage: actual = (a*(x+z)).trace_inner_product(y)
+            sage: expected = ( a*x.trace_inner_product(y) +
+            ....:              a*z.trace_inner_product(y) )
+            sage: actual == expected
+            True
+            sage: actual = x.trace_inner_product(a*(y+z))
+            sage: expected = ( a*x.trace_inner_product(y) +
+            ....:              a*x.trace_inner_product(z) )
+            sage: actual == expected
+            True
+            sage: # associative
+            sage: (x*y).trace_inner_product(z) == y.trace_inner_product(x*z)
+            True
+
+        """
+        if not other in self.parent():
+            raise TypeError("'other' must live in the same algebra")
+
+        return (self*other).trace()
+
+
+    def trace_norm(self):
+        """
+        The norm of this element with respect to :meth:`trace_inner_product`.
+
+        SETUP::
+
+            sage: from mjo.eja.eja_algebra import (JordanSpinEJA,
+            ....:                                  HadamardEJA)
+
+        EXAMPLES::
+
+            sage: J = HadamardEJA(2)
+            sage: x = sum(J.gens())
+            sage: x.trace_norm()
+            1.414213562373095?
+
+        ::
+
+            sage: J = JordanSpinEJA(4)
+            sage: x = sum(J.gens())
+            sage: x.trace_norm()
+            2.828427124746190?
+
+        """
+        return self.trace_inner_product(self).sqrt()
+
+
+    def operator_trace_inner_product(self, other):
         r"""
         Return the operator inner product of myself and ``other``.
 
@@ -1587,10 +1655,10 @@ class EJAElement(IndexedFreeModuleElement):
         Euclidean Jordan algebra, this is another associative inner
         product under which the cone of squares is symmetric.
 
-        This *probably* works even if the basis hasn't been
-        orthonormalized because the eigenvalues of the corresponding
-        matrix don't change when the basis does (they're preserved by
-        any similarity transformation).
+        This works even if the basis hasn't been orthonormalized
+        because the eigenvalues of the corresponding matrix don't
+        change when the basis does (they're preserved by any
+        similarity transformation).
 
         SETUP::
 
@@ -1610,7 +1678,7 @@ class EJAElement(IndexedFreeModuleElement):
             sage: x,y = J.random_elements(2)
             sage: n = J.dimension()
             sage: r = J.rank()
-            sage: actual = x.operator_inner_product(y)
+            sage: actual = x.operator_trace_inner_product(y)
             sage: expected = (n/r)*x.trace_inner_product(y)
             sage: actual == expected
             True
@@ -1621,7 +1689,7 @@ class EJAElement(IndexedFreeModuleElement):
             sage: x,y = J.random_elements(2)
             sage: n = J.dimension()
             sage: r = J.rank()
-            sage: actual = x.operator_inner_product(y)
+            sage: actual = x.operator_trace_inner_product(y)
             sage: expected = (n/r)*x.trace_inner_product(y)
             sage: actual == expected
             True
@@ -1632,7 +1700,7 @@ class EJAElement(IndexedFreeModuleElement):
             sage: x,y = J.random_elements(2)
             sage: n = J.dimension()
             sage: r = J.rank()
-            sage: actual = x.operator_inner_product(y)
+            sage: actual = x.operator_trace_inner_product(y)
             sage: expected = (n/r)*x.trace_inner_product(y)
             sage: actual == expected
             True
@@ -1645,98 +1713,80 @@ class EJAElement(IndexedFreeModuleElement):
             sage: J = random_eja()
             sage: x,y,z = J.random_elements(3)
             sage: # commutative
-            sage: x.operator_inner_product(y) == y.operator_inner_product(x)
+            sage: actual = x.operator_trace_inner_product(y)
+            sage: expected = y.operator_trace_inner_product(x)
+            sage: actual == expected
             True
             sage: # bilinear
             sage: a = J.base_ring().random_element()
-            sage: actual = (a*(x+z)).operator_inner_product(y)
-            sage: expected = ( a*x.operator_inner_product(y) +
-            ....:              a*z.operator_inner_product(y) )
+            sage: actual = (a*(x+z)).operator_trace_inner_product(y)
+            sage: expected = ( a*x.operator_trace_inner_product(y) +
+            ....:              a*z.operator_trace_inner_product(y) )
             sage: actual == expected
             True
-            sage: actual = x.operator_inner_product(a*(y+z))
-            sage: expected = ( a*x.operator_inner_product(y) +
-            ....:              a*x.operator_inner_product(z) )
+            sage: actual = x.operator_trace_inner_product(a*(y+z))
+            sage: expected = ( a*x.operator_trace_inner_product(y) +
+            ....:              a*x.operator_trace_inner_product(z) )
             sage: actual == expected
             True
             sage: # associative
-            sage: actual = (x*y).operator_inner_product(z)
-            sage: expected = y.operator_inner_product(x*z)
+            sage: actual = (x*y).operator_trace_inner_product(z)
+            sage: expected = y.operator_trace_inner_product(x*z)
             sage: actual == expected
             True
 
-        """
-        if not other in self.parent():
-            raise TypeError("'other' must live in the same algebra")
-
-        return (self*other).operator().matrix().trace()
+        Despite the fact that the implementation uses a matrix representation,
+        the answer is independent of the basis used::
 
-
-    def trace_inner_product(self, other):
-        """
-        Return the trace inner product of myself and ``other``.
-
-        SETUP::
-
-            sage: from mjo.eja.eja_algebra import random_eja
-
-        TESTS:
-
-        The trace inner product is commutative, bilinear, and associative::
-
-            sage: J = random_eja()
-            sage: x,y,z = J.random_elements(3)
-            sage: # commutative
-            sage: x.trace_inner_product(y) == y.trace_inner_product(x)
-            True
-            sage: # bilinear
-            sage: a = J.base_ring().random_element()
-            sage: actual = (a*(x+z)).trace_inner_product(y)
-            sage: expected = ( a*x.trace_inner_product(y) +
-            ....:              a*z.trace_inner_product(y) )
-            sage: actual == expected
-            True
-            sage: actual = x.trace_inner_product(a*(y+z))
-            sage: expected = ( a*x.trace_inner_product(y) +
-            ....:              a*x.trace_inner_product(z) )
+            sage: J = RealSymmetricEJA(3, field=QQ, orthonormalize=False)
+            sage: V = RealSymmetricEJA(3)
+            sage: x,y = J.random_elements(2)
+            sage: w = V(x.to_matrix())
+            sage: z = V(y.to_matrix())
+            sage: expected = x.operator_trace_inner_product(y)
+            sage: actual = w.operator_trace_inner_product(z)
             sage: actual == expected
             True
-            sage: # associative
-            sage: (x*y).trace_inner_product(z) == y.trace_inner_product(x*z)
-            True
 
         """
         if not other in self.parent():
             raise TypeError("'other' must live in the same algebra")
 
-        return (self*other).trace()
+        return (self*other).operator().matrix().trace()
 
 
-    def trace_norm(self):
+    def operator_trace_norm(self):
         """
-        The norm of this element with respect to :meth:`trace_inner_product`.
+        The norm of this element with respect to
+        :meth:`operator_trace_inner_product`.
 
         SETUP::
 
             sage: from mjo.eja.eja_algebra import (JordanSpinEJA,
             ....:                                  HadamardEJA)
 
-        EXAMPLES::
+        EXAMPLES:
+
+        On a simple algebra, this will differ from :meth:`trace_norm`
+        by the scalar factor ``(n/r).sqrt()``, where `n` is the
+        dimension of the algebra and `r` its rank. This follows from
+        the corresponding result (Proposition III.4.2 of Faraut and
+        Korányi) for the trace inner product::
 
             sage: J = HadamardEJA(2)
             sage: x = sum(J.gens())
-            sage: x.trace_norm()
+            sage: x.operator_trace_norm()
             1.414213562373095?
 
         ::
 
             sage: J = JordanSpinEJA(4)
             sage: x = sum(J.gens())
-            sage: x.trace_norm()
-            2.828427124746190?
+            sage: x.operator_trace_norm()
+            4
 
         """
-        return self.trace_inner_product(self).sqrt()
+        return self.operator_trace_inner_product(self).sqrt()
 
 
 class CartesianProductParentEJAElement(EJAElement):