]> gitweb.michael.orlitzky.com - dunshire.git/commitdiff
Add setup.py and reorganize everything to make its "test" command happy.
authorMichael Orlitzky <michael@orlitzky.com>
Wed, 26 Oct 2016 18:05:20 +0000 (14:05 -0400)
committerMichael Orlitzky <michael@orlitzky.com>
Wed, 26 Oct 2016 18:05:20 +0000 (14:05 -0400)
12 files changed:
dunshire/__init__.py [moved from src/dunshire/__init__.py with 100% similarity]
dunshire/cones.py [moved from src/dunshire/cones.py with 100% similarity]
dunshire/errors.py [moved from src/dunshire/errors.py with 100% similarity]
dunshire/games.py [moved from src/dunshire/games.py with 100% similarity]
dunshire/matrices.py [moved from src/dunshire/matrices.py with 100% similarity]
dunshire/options.py [moved from src/dunshire/options.py with 100% similarity]
makefile
setup.py [new file with mode: 0644]
src/test/__init__.py [deleted file]
src/test/symmetric_linear_game_test.py [deleted file]
test/__init__.py [moved from src/test/suite.py with 73% similarity]
test/__main__.py [new file with mode: 0644]

similarity index 100%
rename from src/dunshire/cones.py
rename to dunshire/cones.py
similarity index 100%
rename from src/dunshire/errors.py
rename to dunshire/errors.py
similarity index 100%
rename from src/dunshire/games.py
rename to dunshire/games.py
similarity index 100%
rename from src/dunshire/options.py
rename to dunshire/options.py
index 7fe104e2140476613e6a08c00c97fc5304e7ed6a..0cd51823d36ae7faabae243778b6d66319fc7a35 100644 (file)
--- a/makefile
+++ b/makefile
@@ -1,5 +1,5 @@
 PN := dunshire
-SRCS := src/$(PN)/*.py src/test/*.py
+SRCS := $(PN)/*.py test/*.py
 
 doc: $(SRCS) doc/source/conf.py doc/makefile
        cd doc && $(MAKE) html
@@ -10,7 +10,7 @@ doctest:
 
 .PHONY: check
 check:
-       PYTHONPATH=src python src/test/suite.py
+       PYTHONPATH="." python test/
 
 .PHONY: lint
 lint:
@@ -18,4 +18,5 @@ lint:
 
 .PHONY: clean
 clean:
-       rm -rf src/$(PN)/__pycache__ src/test/__pycache__ doc/build
+       rm -rf $(PN)/__pycache__ test/__pycache__ doc/build
+       rm -rf $(PN).egg-info
diff --git a/setup.py b/setup.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..8e81428
--- /dev/null
+++ b/setup.py
@@ -0,0 +1,14 @@
+from setuptools import setup
+
+setup(
+    name         = 'dunshire',
+    version      = '0.0.1',
+    author       = 'Michael Orlitzky',
+    author_email = 'michael@orlitzky.com',
+    url          = 'http://michael.orlitzky.com/code/dunshire.php',
+    packages     = ['dunshire'],
+    description  = 'A library for solving linear (cone) games',
+    license      = 'doc/LICENSE',
+    install_requires = [ 'cvxopt >= 1.1.8' ],
+    test_suite = 'test.build_suite'
+)
diff --git a/src/test/__init__.py b/src/test/__init__.py
deleted file mode 100644 (file)
index c5fbe98..0000000
+++ /dev/null
@@ -1 +0,0 @@
-# <3 git.
diff --git a/src/test/symmetric_linear_game_test.py b/src/test/symmetric_linear_game_test.py
deleted file mode 100644 (file)
index 647d013..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,528 +0,0 @@
-"""
-Unit tests for the :class:`SymmetricLinearGame` class.
-"""
-
-from math import sqrt
-from random import randint, uniform
-from unittest import TestCase
-
-from cvxopt import matrix
-from dunshire.cones import NonnegativeOrthant, IceCream
-from dunshire.games import SymmetricLinearGame
-from dunshire.matrices import (append_col, append_row, eigenvalues_re,
-                               identity, inner_product)
-from dunshire import options
-
-
-def random_matrix(dims):
-    """
-    Generate a random square matrix.
-
-    Parameters
-    ----------
-
-    dims : int
-        The number of rows/columns you want in the returned matrix.
-
-    Returns
-    -------
-
-    matrix
-        A new matrix whose entries are random floats chosen uniformly from
-        the interval [-10, 10].
-
-    Examples
-    --------
-
-        >>> A = random_matrix(3)
-        >>> A.size
-        (3, 3)
-
-    """
-    return matrix([[uniform(-10, 10) for i in range(dims)]
-                   for j in range(dims)])
-
-
-def random_nonnegative_matrix(dims):
-    """
-    Generate a random square matrix with nonnegative entries.
-
-    Parameters
-    ----------
-
-    dims : int
-        The number of rows/columns you want in the returned matrix.
-
-    Returns
-    -------
-
-    matrix
-        A new matrix whose entries are random floats chosen uniformly from
-        the interval [0, 10].
-
-    Examples
-    --------
-
-        >>> A = random_nonnegative_matrix(3)
-        >>> A.size
-        (3, 3)
-        >>> all([entry >= 0 for entry in A])
-        True
-
-    """
-    L = random_matrix(dims)
-    return matrix([abs(entry) for entry in L], (dims, dims))
-
-
-def random_diagonal_matrix(dims):
-    """
-    Generate a random square matrix with zero off-diagonal entries.
-
-    These matrices are Lyapunov-like on the nonnegative orthant, as is
-    fairly easy to see.
-
-    Parameters
-    ----------
-
-    dims : int
-        The number of rows/columns you want in the returned matrix.
-
-    Returns
-    -------
-
-    matrix
-        A new matrix whose diagonal entries are random floats chosen
-        uniformly from the interval [-10, 10] and whose off-diagonal
-        entries are zero.
-
-    Examples
-    --------
-
-        >>> A = random_diagonal_matrix(3)
-        >>> A.size
-        (3, 3)
-        >>> A[0,1] == A[0,2] == A[1,0] == A[2,0] == A[1,2] == A[2,1] == 0
-        True
-
-    """
-    return matrix([[uniform(-10, 10)*int(i == j) for i in range(dims)]
-                   for j in range(dims)])
-
-
-def random_skew_symmetric_matrix(dims):
-    """
-    Generate a random skew-symmetrix matrix.
-
-    Parameters
-    ----------
-
-    dims : int
-        The number of rows/columns you want in the returned matrix.
-
-    Returns
-    -------
-
-    matrix
-        A new skew-matrix whose strictly above-diagonal entries are
-        random floats chosen uniformly from the interval [-10, 10].
-
-    Examples
-    --------
-
-        >>> A = random_skew_symmetric_matrix(3)
-        >>> A.size
-        (3, 3)
-
-        >>> from dunshire.matrices import norm
-        >>> A = random_skew_symmetric_matrix(randint(1, 10))
-        >>> norm(A + A.trans()) < options.ABS_TOL
-        True
-
-    """
-    strict_ut = [[uniform(-10, 10)*int(i < j) for i in range(dims)]
-                 for j in range(dims)]
-
-    strict_ut = matrix(strict_ut, (dims, dims))
-    return strict_ut - strict_ut.trans()
-
-
-def random_lyapunov_like_icecream(dims):
-    r"""
-    Generate a random matrix Lyapunov-like on the ice-cream cone.
-
-    The form of these matrices is cited in Gowda and Tao
-    [GowdaTao]_. The scalar ``a`` and the vector ``b`` (using their
-    notation) are easy to generate. The submatrix ``D`` is a little
-    trickier, but it can be found noticing that :math:`C + C^{T} = 0`
-    for a skew-symmetric matrix :math:`C` implying that :math:`C + C^{T}
-    + \left(2a\right)I = \left(2a\right)I`. Thus we can stick an
-    :math:`aI` with each of :math:`C,C^{T}` and let those be our
-    :math:`D,D^{T}`.
-
-    Parameters
-    ----------
-
-    dims : int
-        The dimension of the ice-cream cone (not of the matrix you want!)
-        on which the returned matrix should be Lyapunov-like.
-
-    Returns
-    -------
-
-    matrix
-        A new matrix, Lyapunov-like on the ice-cream cone in ``dims``
-        dimensions, whose free entries are random floats chosen uniformly
-        from the interval [-10, 10].
-
-    References
-    ----------
-
-    .. [GowdaTao] M. S. Gowda and J. Tao. On the bilinearity rank of a
-       proper cone and Lyapunov-like transformations. Mathematical
-       Programming, 147:155–170, 2014.
-
-    Examples
-    --------
-
-        >>> L = random_lyapunov_like_icecream(3)
-        >>> L.size
-        (3, 3)
-        >>> x = matrix([1,1,0])
-        >>> s = matrix([1,-1,0])
-        >>> abs(inner_product(L*x, s)) < options.ABS_TOL
-        True
-
-    """
-    a = matrix([uniform(-10, 10)], (1, 1))
-    b = matrix([uniform(-10, 10) for idx in range(dims-1)], (dims-1, 1))
-    D = random_skew_symmetric_matrix(dims-1) + a*identity(dims-1)
-    row1 = append_col(a, b.trans())
-    row2 = append_col(b, D)
-    return append_row(row1, row2)
-
-
-def random_orthant_params():
-    """
-    Generate the ``L``, ``K``, ``e1``, and ``e2`` parameters for a
-    random game over the nonnegative orthant.
-    """
-    ambient_dim = randint(1, 10)
-    K = NonnegativeOrthant(ambient_dim)
-    e1 = [uniform(0.5, 10) for idx in range(K.dimension())]
-    e2 = [uniform(0.5, 10) for idx in range(K.dimension())]
-    L = random_matrix(K.dimension())
-    return (L, K, matrix(e1), matrix(e2))
-
-
-def random_icecream_params():
-    """
-    Generate the ``L``, ``K``, ``e1``, and ``e2`` parameters for a
-    random game over the ice-cream cone.
-    """
-    # Use a minimum dimension of two to avoid divide-by-zero in
-    # the fudge factor we make up later.
-    ambient_dim = randint(2, 10)
-    K = IceCream(ambient_dim)
-    e1 = [1] # Set the "height" of e1 to one
-    e2 = [1] # And the same for e2
-
-    # If we choose the rest of the components of e1,e2 randomly
-    # between 0 and 1, then the largest the squared norm of the
-    # non-height part of e1,e2 could be is the 1*(dim(K) - 1). We
-    # need to make it less than one (the height of the cone) so
-    # that the whole thing is in the cone. The norm of the
-    # non-height part is sqrt(dim(K) - 1), and we can divide by
-    # twice that.
-    fudge_factor = 1.0 / (2.0*sqrt(K.dimension() - 1.0))
-    e1 += [fudge_factor*uniform(0, 1) for idx in range(K.dimension() - 1)]
-    e2 += [fudge_factor*uniform(0, 1) for idx in range(K.dimension() - 1)]
-    L = random_matrix(K.dimension())
-
-    return (L, K, matrix(e1), matrix(e2))
-
-
-# Tell pylint to shut up about the large number of methods.
-class SymmetricLinearGameTest(TestCase): # pylint: disable=R0904
-    """
-    Tests for the SymmetricLinearGame and Solution classes.
-    """
-    def assert_within_tol(self, first, second):
-        """
-        Test that ``first`` and ``second`` are equal within our default
-        tolerance.
-        """
-        self.assertTrue(abs(first - second) < options.ABS_TOL)
-
-
-    def assert_solution_exists(self, L, K, e1, e2):
-        """
-        Given the parameters needed to construct a SymmetricLinearGame,
-        ensure that that game has a solution.
-        """
-        # The matrix() constructor assumes that ``L`` is a list of
-        # columns, so we transpose it to agree with what
-        # SymmetricLinearGame() thinks.
-        G = SymmetricLinearGame(L.trans(), K, e1, e2)
-        soln = G.solution()
-
-        expected = inner_product(L*soln.player1_optimal(),
-                                 soln.player2_optimal())
-        self.assert_within_tol(soln.game_value(), expected)
-
-
-    def test_solution_exists_orthant(self):
-        """
-        Every linear game has a solution, so we should be able to solve
-        every symmetric linear game over the NonnegativeOrthant. Pick
-        some parameters randomly and give it a shot. The resulting
-        optimal solutions should give us the optimal game value when we
-        apply the payoff operator to them.
-        """
-        (L, K, e1, e2) = random_orthant_params()
-        self.assert_solution_exists(L, K, e1, e2)
-
-
-    def test_solution_exists_icecream(self):
-        """
-        Like :meth:`test_solution_exists_nonnegative_orthant`, except
-        over the ice cream cone.
-        """
-        (L, K, e1, e2) = random_icecream_params()
-        self.assert_solution_exists(L, K, e1, e2)
-
-
-    def test_negative_value_z_operator(self):
-        """
-        Test the example given in Gowda/Ravindran of a Z-matrix with
-        negative game value on the nonnegative orthant.
-        """
-        K = NonnegativeOrthant(2)
-        e1 = [1, 1]
-        e2 = e1
-        L = [[1, -2], [-2, 1]]
-        G = SymmetricLinearGame(L, K, e1, e2)
-        self.assertTrue(G.solution().game_value() < -options.ABS_TOL)
-
-
-    def assert_scaling_works(self, L, K, e1, e2):
-        """
-        Test that scaling ``L`` by a nonnegative number scales the value
-        of the game by the same number.
-        """
-        game1 = SymmetricLinearGame(L, K, e1, e2)
-        value1 = game1.solution().game_value()
-
-        alpha = uniform(0.1, 10)
-        game2 = SymmetricLinearGame(alpha*L, K, e1, e2)
-        value2 = game2.solution().game_value()
-        self.assert_within_tol(alpha*value1, value2)
-
-
-    def test_scaling_orthant(self):
-        """
-        Test that scaling ``L`` by a nonnegative number scales the value
-        of the game by the same number over the nonnegative orthant.
-        """
-        (L, K, e1, e2) = random_orthant_params()
-        self.assert_scaling_works(L, K, e1, e2)
-
-
-    def test_scaling_icecream(self):
-        """
-        The same test as :meth:`test_nonnegative_scaling_orthant`,
-        except over the ice cream cone.
-        """
-        (L, K, e1, e2) = random_icecream_params()
-        self.assert_scaling_works(L, K, e1, e2)
-
-
-    def assert_translation_works(self, L, K, e1, e2):
-        """
-        Check that translating ``L`` by alpha*(e1*e2.trans()) increases
-        the value of the associated game by alpha.
-        """
-        # We need to use ``L`` later, so make sure we transpose it
-        # before passing it in as a column-indexed matrix.
-        game1 = SymmetricLinearGame(L.trans(), K, e1, e2)
-        soln1 = game1.solution()
-        value1 = soln1.game_value()
-        x_bar = soln1.player1_optimal()
-        y_bar = soln1.player2_optimal()
-
-        alpha = uniform(-10, 10)
-        tensor_prod = e1*e2.trans()
-
-        # This is the "correct" representation of ``M``, but COLUMN
-        # indexed...
-        M = L + alpha*tensor_prod
-
-        # so we have to transpose it when we feed it to the constructor.
-        game2 = SymmetricLinearGame(M.trans(), K, e1, e2)
-        value2 = game2.solution().game_value()
-
-        self.assert_within_tol(value1 + alpha, value2)
-
-        # Make sure the same optimal pair works.
-        self.assert_within_tol(value2, inner_product(M*x_bar, y_bar))
-
-
-    def test_translation_orthant(self):
-        """
-        Test that translation works over the nonnegative orthant.
-        """
-        (L, K, e1, e2) = random_orthant_params()
-        self.assert_translation_works(L, K, e1, e2)
-
-
-    def test_translation_icecream(self):
-        """
-        The same as :meth:`test_translation_orthant`, except over the
-        ice cream cone.
-        """
-        (L, K, e1, e2) = random_icecream_params()
-        self.assert_translation_works(L, K, e1, e2)
-
-
-    def assert_opposite_game_works(self, L, K, e1, e2):
-        """
-        Check the value of the "opposite" game that gives rise to a
-        value that is the negation of the original game. Comes from
-        some corollary.
-        """
-        # We need to use ``L`` later, so make sure we transpose it
-        # before passing it in as a column-indexed matrix.
-        game1 = SymmetricLinearGame(L.trans(), K, e1, e2)
-
-        # This is the "correct" representation of ``M``, but
-        # COLUMN indexed...
-        M = -L.trans()
-
-        # so we have to transpose it when we feed it to the constructor.
-        game2 = SymmetricLinearGame(M.trans(), K, e2, e1)
-
-        soln1 = game1.solution()
-        x_bar = soln1.player1_optimal()
-        y_bar = soln1.player2_optimal()
-        soln2 = game2.solution()
-
-        self.assert_within_tol(-soln1.game_value(), soln2.game_value())
-
-        # Make sure the switched optimal pair works.
-        self.assert_within_tol(soln2.game_value(),
-                               inner_product(M*y_bar, x_bar))
-
-
-    def test_opposite_game_orthant(self):
-        """
-        Test the value of the "opposite" game over the nonnegative
-        orthant.
-        """
-        (L, K, e1, e2) = random_orthant_params()
-        self.assert_opposite_game_works(L, K, e1, e2)
-
-
-    def test_opposite_game_icecream(self):
-        """
-        Like :meth:`test_opposite_game_orthant`, except over the
-        ice-cream cone.
-        """
-        (L, K, e1, e2) = random_icecream_params()
-        self.assert_opposite_game_works(L, K, e1, e2)
-
-
-    def assert_orthogonality(self, L, K, e1, e2):
-        """
-        Two orthogonality relations hold at an optimal solution, and we
-        check them here.
-        """
-        # We need to use ``L`` later, so make sure we transpose it
-        # before passing it in as a column-indexed matrix.
-        game = SymmetricLinearGame(L.trans(), K, e1, e2)
-        soln = game.solution()
-        x_bar = soln.player1_optimal()
-        y_bar = soln.player2_optimal()
-        value = soln.game_value()
-
-        ip1 = inner_product(y_bar, L*x_bar - value*e1)
-        self.assert_within_tol(ip1, 0)
-
-        ip2 = inner_product(value*e2 - L.trans()*y_bar, x_bar)
-        self.assert_within_tol(ip2, 0)
-
-
-    def test_orthogonality_orthant(self):
-        """
-        Check the orthgonality relationships that hold for a solution
-        over the nonnegative orthant.
-        """
-        (L, K, e1, e2) = random_orthant_params()
-        self.assert_orthogonality(L, K, e1, e2)
-
-
-    def test_orthogonality_icecream(self):
-        """
-        Check the orthgonality relationships that hold for a solution
-        over the ice-cream cone.
-        """
-        (L, K, e1, e2) = random_icecream_params()
-        self.assert_orthogonality(L, K, e1, e2)
-
-
-    def test_positive_operator_value(self):
-        """
-        Test that a positive operator on the nonnegative orthant gives
-        rise to a a game with a nonnegative value.
-
-        This test theoretically applies to the ice-cream cone as well,
-        but we don't know how to make positive operators on that cone.
-        """
-        (K, e1, e2) = random_orthant_params()[1:]
-        L = random_nonnegative_matrix(K.dimension())
-
-        game = SymmetricLinearGame(L, K, e1, e2)
-        self.assertTrue(game.solution().game_value() >= -options.ABS_TOL)
-
-
-    def assert_lyapunov_works(self, L, K, e1, e2):
-        """
-        Check that Lyapunov games act the way we expect.
-        """
-        game = SymmetricLinearGame(L, K, e1, e2)
-        soln = game.solution()
-
-        # We only check for positive/negative stability if the game
-        # value is not basically zero. If the value is that close to
-        # zero, we just won't check any assertions.
-        eigs = eigenvalues_re(L)
-        if soln.game_value() > options.ABS_TOL:
-            # L should be positive stable
-            positive_stable = all([eig > -options.ABS_TOL for eig in eigs])
-            self.assertTrue(positive_stable)
-        elif soln.game_value() < -options.ABS_TOL:
-            # L should be negative stable
-            negative_stable = all([eig < options.ABS_TOL for eig in eigs])
-            self.assertTrue(negative_stable)
-
-        # The dual game's value should always equal the primal's.
-        dualsoln = game.dual().solution()
-        self.assert_within_tol(dualsoln.game_value(), soln.game_value())
-
-
-    def test_lyapunov_orthant(self):
-        """
-        Test that a Lyapunov game on the nonnegative orthant works.
-        """
-        (K, e1, e2) = random_orthant_params()[1:]
-        L = random_diagonal_matrix(K.dimension())
-
-        self.assert_lyapunov_works(L, K, e1, e2)
-
-
-    def test_lyapunov_icecream(self):
-        """
-        Test that a Lyapunov game on the ice-cream cone works.
-        """
-        (K, e1, e2) = random_icecream_params()[1:]
-        L = random_lyapunov_like_icecream(K.dimension())
-
-        self.assert_lyapunov_works(L, K, e1, e2)
similarity index 73%
rename from src/test/suite.py
rename to test/__init__.py
index e10c38d98a3401a2f0a37fa033f77d3e2270863a..6942bf2f2af83c8749bae65c586f685ec5b95e08 100644 (file)
@@ -2,7 +2,9 @@
 The whole test suite.
 
 This module compiles the doctests and unittests from the rest of the
-codebase into one big TestSuite() and the runs it.
+codebase into one big TestSuite() and the runs it. It also provides a
+function :func:`build_suite` that merely builds the suite; the result
+can be used by setuptools.
 """
 
 from unittest import TestLoader, TestSuite, TextTestRunner
@@ -14,10 +16,9 @@ from dunshire import matrices
 from dunshire import games
 from test import symmetric_linear_game_test
 
-def run_suite():
+def build_suite():
     """
-    Run all of the unit and doctests for the ``dunshire`` and ``test``
-    packages.
+    Build our test suite, separately from running it.
     """
     suite = TestSuite()
     suite.addTest(DocTestSuite(cones))
@@ -27,8 +28,12 @@ def run_suite():
     suite.addTest(DocTestSuite(symmetric_linear_game_test))
     slg_tests = TestLoader().loadTestsFromModule(symmetric_linear_game_test)
     suite.addTest(slg_tests)
-    runner = TextTestRunner(verbosity=1)
-    runner.run(suite)
+    return suite
 
-if __name__ == '__main__':
-    run_suite()
+def run_suite(s):
+    """
+    Run all of the unit and doctests for the ``dunshire`` and ``test``
+    packages.
+    """
+    runner = TextTestRunner(verbosity=1)
+    runner.run(s)
diff --git a/test/__main__.py b/test/__main__.py
new file mode 100644 (file)
index 0000000..175c884
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,3 @@
+from test import build_suite, run_suite
+
+run_suite(build_suite())