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Add 'coefficients' to FEM.R1 which solves the desired system.
authorMichael Orlitzky <michael@orlitzky.com>
Sun, 16 Feb 2014 02:27:34 +0000 (21:27 -0500)
committerMichael Orlitzky <michael@orlitzky.com>
Sun, 16 Feb 2014 02:27:34 +0000 (21:27 -0500)
src/FEM/R1.hs

index 098dcf34530ed1ccb26c5f79532f1a9f4cfd9156..922469f730dff4af6ed9d8387928c60335acd223 100644 (file)
@@ -45,7 +45,9 @@ import Linear.Matrix (
   construct,
   fromList,
   ifoldl2,
-  nrows )
+  nrows,
+  set_idx )
+import Linear.System ( solve_positive_definite )
 import Polynomials.Orthogonal ( legendre )
 
 -- | Dirichlet boundary conditions. Since u(a)=u(b)=0 are fixed,
@@ -185,6 +187,8 @@ affine_inv (x1,x2) x =
     two = fromInteger 2
 
 
+-- * Load vector
+
 -- | Normalized integrals of orthogonal basis functions over
 --   n[-1,1]. The test case below comes from Sage where the
 --   orthogonality of the polynomials' derivatives can easily be
@@ -255,51 +259,22 @@ big_N_matrix =
     lambda _ j x = big_N (toInteger j) x
 
 
-
-
--- | Derivatives of the 'big_N's, that is, orthogonal basis functions
---   over [-1,1]. The test case below comes from Sage where the
---   orthogonality of the polynomials' derivatives can easily be
---   tested. The indices are shifted by one so that k=0 is the first
---   basis function.
---
---   Examples:
---
---   >>> import qualified Algebra.Absolute as Absolute ( abs )
---
---   >>> let expected = 11.5757525403319
---   >>> let actual = big_N' 3 1.5 :: Double
---   >>> Absolute.abs (actual - expected) < 1e-10
---   True
---
-big_N' :: forall a. (Algebraic.C a, RealField.C a) => Integer -> a -> a
-big_N' k x
-  | k < 0 = error "requested a negative basis function"
-  | k == 0 = negate ( one / (fromInteger 2))
-  | k == 1 = one / (fromInteger 2)
-  | otherwise = coeff * ( legendre k x )
-      where
-        two = fromInteger 2
-        coeff = sqrt ((two*(fromInteger k) + one) / two) :: a
-
-
--- | The matrix of (N_i' * N_j') functions used in the integrand of
---  the stiffness/mass matrices.
-big_N's_matrix :: (Arity m, Arity n, Algebraic.C a, RealField.C a)
+-- | The matrix of (N_i * N_j) functions used in the integrand of
+--   the mass matrices.
+big_Ns_matrix :: (Arity m, Arity n, Algebraic.C a, RealField.C a)
                => Mat m n (a -> a)
-big_N's_matrix =
+big_Ns_matrix =
   construct lambda
   where
-    lambda i j x = (big_N' (toInteger i) x) * (big_N' (toInteger j) x)
+    lambda i j x = (big_N (toInteger i) x) * (big_N (toInteger j) x)
 
 
 -- | Compute the global load vector F.
 --
 --   Examples:
 --
---   >>> import Data.Vector.Fixed ( N3, N4 )
 --   >>> import Linear.Matrix ( Col4, frobenius_norm, fromList )
---   >>> import Naturals ( N7 )
+--   >>> import Naturals ( N3, N4, N7 )
 --
 --   >>> let big_A = const (1::Double)
 --   >>> let c x = sin x
@@ -347,12 +322,47 @@ big_F pde params =
 
         -- The pointer matrix numbers from 1 so subtract one here to
         -- get the right index.
-        global_idx = ((pointer params) !!! (i,j)) - 1
-        this_F = construct lambda
-        lambda k _ = if k == global_idx
-                     then (gaussian integrand)*(x2 - x1) / two
-                     else fromInteger 0
+        k = ((pointer params) !!! (i,j)) - 1
+        integral = (gaussian integrand)*(x2 - x1) / two
+        this_F = set_idx zero (k,0) integral
+
+
+-- * Stiffness matrix
+
+-- | Derivatives of the 'big_N's, that is, orthogonal basis functions
+--   over [-1,1]. The test case below comes from Sage where the
+--   orthogonality of the polynomials' derivatives can easily be
+--   tested. The indices are shifted by one so that k=0 is the first
+--   basis function.
+--
+--   Examples:
+--
+--   >>> import qualified Algebra.Absolute as Absolute ( abs )
+--
+--   >>> let expected = 11.5757525403319
+--   >>> let actual = big_N' 3 1.5 :: Double
+--   >>> Absolute.abs (actual - expected) < 1e-10
+--   True
+--
+big_N' :: forall a. (Algebraic.C a, RealField.C a) => Integer -> a -> a
+big_N' k x
+  | k < 0 = error "requested a negative basis function"
+  | k == 0 = negate ( one / (fromInteger 2))
+  | k == 1 = one / (fromInteger 2)
+  | otherwise = coeff * ( legendre k x )
+      where
+        two = fromInteger 2
+        coeff = sqrt ((two*(fromInteger k) + one) / two) :: a
+
 
+-- | The matrix of (N_i' * N_j') functions used in the integrand of
+--   the stiffness matrix.
+big_N's_matrix :: (Arity m, Arity n, Algebraic.C a, RealField.C a)
+               => Mat m n (a -> a)
+big_N's_matrix =
+  construct lambda
+  where
+    lambda i j x = (big_N' (toInteger i) x) * (big_N' (toInteger j) x)
 
 
 big_K_elem :: forall m n l a b.
@@ -378,12 +388,10 @@ big_K_elem pde params _ k cur_K _ =
         integrand x = ((big_A pde) (q x)) * (these_N's x)
         -- The pointer matrix numbers from 1 so subtract one here to
         -- get the right index.
-        global_row_idx = ((pointer params) !!! (k,i)) - 1
-        global_col_idx = ((pointer params) !!! (k,j)) - 1
-        this_K = construct lambda
-        lambda v w = if v == global_row_idx && w == global_col_idx
-                     then (two/(x2 - x1))* (gaussian integrand)
-                     else fromInteger 0
+        row_idx = ((pointer params) !!! (k,i)) - 1
+        col_idx = ((pointer params) !!! (k,j)) - 1
+        integral = (two/(x2 - x1))* (gaussian integrand)
+        this_K = set_idx zero (row_idx, col_idx) integral
 
 
 
@@ -394,9 +402,8 @@ big_K_elem pde params _ k cur_K _ =
 --
 --   Examples:
 --
---   >>> import Data.Vector.Fixed ( N3, N4 )
 --   >>> import Linear.Matrix ( Col4, frobenius_norm, fromList )
---   >>> import Naturals ( N7 )
+--   >>> import Naturals ( N3, N4, N7 )
 --
 --   >>> let big_A = const (1::Double)
 --   >>> let c x = sin x
@@ -435,3 +442,129 @@ big_K pde params =
   where
     col_idxs = fromList [map fromInteger [0..]] :: Row m a
 
+
+-- * Mass matrix
+
+big_M_elem :: forall m n l a b.
+         (Arity l, Arity m, Arity n,
+          Algebraic.C a, RealField.C a, ToRational.C a)
+      => PDE a
+      -> Params m n l a
+      -> Int
+      -> Int
+      -> Mat l l a
+      -> b
+      -> Mat l l a
+big_M_elem pde params _ k cur_M _ =
+  ifoldl2 accum cur_M (big_Ns_matrix :: Mat m (S n) (a -> a))
+  where
+    accum :: Int -> Int -> Mat l l a -> (a -> a) -> Mat l l a
+    accum i j prev_M these_Ns =
+      prev_M + this_M
+      where
+        two = fromInteger 2
+        (x1,x2) = (mesh params) !!! (k,0)
+        q = affine_inv (x1,x2)
+        integrand x = ((c pde) (q x)) * (these_Ns x)
+        -- The pointer matrix numbers from 1 so subtract one here to
+        -- get the right index.
+        row_idx = ((pointer params) !!! (k,i)) - 1
+        col_idx = ((pointer params) !!! (k,j)) - 1
+        integral = (x2 - x1)*(gaussian integrand) / two
+        this_M = set_idx zero (row_idx, col_idx) integral
+
+
+-- | Compute the \"big M\" mass matrix. There are three
+--   parameters needed for M, namely i,j,k so a fold over a matrix will
+--   not do. This little gimmick simulates a three-index fold by doing a
+--   two-index fold over a row of the proper dimensions.
+--
+--   Examples:
+--
+--   >>> import Linear.Matrix ( Col4, frobenius_norm, fromList )
+--   >>> import Naturals ( N3, N4, N7 )
+--
+--   >>> let big_A = const (1::Double)
+--   >>> let c x = sin x
+--   >>> let f x = x*(sin x)
+--   >>> let bdy = Left (Dirichlet (0,1::Double))
+--   >>> let pde = PDE big_A c f bdy
+--
+--   >>> let i1 = (0.0,1/3)
+--   >>> let i2 = (1/3,2/3)
+--   >>> let i3 = (2/3,4/5)
+--   >>> let i4 = (4/5,1.0)
+--   >>> let mesh = fromList [[i1], [i2], [i3], [i4]] :: Col4 (Double,Double)
+--   >>> let pvec = fromList [[2],[3],[2],[1]] :: Col4 Int
+--   >>> let params = Params mesh pvec :: Params N4 N3 N7 Double
+--
+--   >>> let m1 = [0.0723,0.0266,0,-0.0135,-0.0305,0.0058,0] :: [Double]
+--   >>> let m2 = [0.0266,0.0897,0.0149,0,-0.0345,-0.0109,-0.0179] :: [Double]
+--   >>> let m3 = [0,0.0149,0.0809,0,0,0,-0.0185] :: [Double]
+--   >>> let m4 = [-0.0135,0,0,0.0110,0,0,0] :: [Double]
+--   >>> let m5 = [-0.0305,-0.0345,0,0,0.0319,0.0018,0] :: [Double]
+--   >>> let m6 = [0.0058,-0.0109,0,0,0.0018,0.0076,0] :: [Double]
+--   >>> let m7 = [0,-0.0179,-0.0185,0,0,0,0.0178] :: [Double]
+--
+--   >>> let expected = fromList [m1,m2,m3,m4,m5,m6,m7] :: Mat N7 N7 Double
+--   >>> let actual = big_M pde params
+--   >>> frobenius_norm (actual - expected) < 1e-3
+--   True
+--
+big_M :: forall m n l a.
+         (Arity l, Arity m, Arity n,
+          Algebraic.C a, RealField.C a, ToRational.C a)
+      => PDE a
+      -> Params m n l a
+      -> Mat l l a
+big_M pde params =
+  ifoldl2 (big_M_elem pde params) zero col_idxs
+  where
+    col_idxs = fromList [map fromInteger [0..]] :: Row m a
+
+
+
+-- | Determine the coefficient vector @x@ from the system @(K + M)x = F@.
+--
+--   Examples:
+--
+--   >>> import Linear.Matrix ( Col4, Col7, frobenius_norm, fromList )
+--   >>> import Naturals ( N3, N4, N7 )
+--
+--   >>> let big_A = const (1::Double)
+--   >>> let c x = sin x
+--   >>> let f x = x*(sin x)
+--   >>> let bdy = Left (Dirichlet (0,1::Double))
+--   >>> let pde = PDE big_A c f bdy
+--
+--   >>> let i1 = (0.0,1/3)
+--   >>> let i2 = (1/3,2/3)
+--   >>> let i3 = (2/3,4/5)
+--   >>> let i4 = (4/5,1.0)
+--   >>> let mesh = fromList [[i1], [i2], [i3], [i4]] :: Col4 (Double,Double)
+--   >>> let pvec = fromList [[2],[3],[2],[1]] :: Col4 Int
+--   >>> let params = Params mesh pvec :: Params N4 N3 N7 Double
+--
+--   >>> let c1 = [0.02366220347687] :: [Double]
+--   >>> let c2 = [0.03431630082636] :: [Double]
+--   >>> let c3 = [0.02841800893264] :: [Double]
+--   >>> let c4 = [-0.00069489654996] :: [Double]
+--   >>> let c5 = [-0.00518637005151] :: [Double]
+--   >>> let c6 = [-0.00085028505337] :: [Double]
+--   >>> let c7 = [-0.00170478210110] :: [Double]
+--   >>> let expected = fromList [c1,c2,c3,c4,c5,c6,c7] :: Col7 Double
+--   >>> let actual = coefficients pde params
+--   >>> frobenius_norm (actual - expected) < 1e-8
+--   True
+--
+coefficients :: forall m n l a.
+                (Arity m, Arity n, Arity l,
+                 Algebraic.C a, Eq a, RealField.C a, ToRational.C a)
+             => PDE a
+             -> Params m n (S l) a
+             -> Col (S l) a
+coefficients pde params =
+  solve_positive_definite matrix b
+  where
+    matrix = (big_K pde params) + (big_M pde params)
+    b      = big_F pde params